MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO02

Total Repeats: 1299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008766	ATC	2	6	10	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582554
2	NC_008766	GCC	2	6	31	36	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
3	NC_008766	GGC	2	6	151	156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
4	NC_008766	GAC	2	6	229	234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
5	NC_008766	GCC	2	6	235	240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
6	NC_008766	CTG	2	6	244	249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582554
7	NC_008766	GCCG	2	8	300	307	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
8	NC_008766	GC	3	6	312	317	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
9	NC_008766	CTG	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582554
10	NC_008766	CAT	2	6	330	335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582554
11	NC_008766	CGC	2	6	336	341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
12	NC_008766	GGA	2	6	372	377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582554
13	NC_008766	CCG	2	6	384	389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
14	NC_008766	GCG	2	6	494	499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
15	NC_008766	TCAT	2	8	505	512	25 %	50 %	0 %	25 %	121582554
16	NC_008766	CCG	2	6	548	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
17	NC_008766	GCA	2	6	609	614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
18	NC_008766	GAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582554
19	NC_008766	AGC	2	6	707	712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
20	NC_008766	GCACC	2	10	722	731	20 %	0 %	20 %	60 %	121582554
21	NC_008766	ACC	2	6	787	792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582554
22	NC_008766	GCC	3	9	874	882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
23	NC_008766	GC	3	6	887	892	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
24	NC_008766	GAACA	2	10	946	955	60 %	0 %	20 %	20 %	121582554
25	NC_008766	CGGC	2	8	969	976	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
26	NC_008766	CG	3	6	1031	1036	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
27	NC_008766	TTC	2	6	1039	1044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582554
28	NC_008766	GCC	2	6	1080	1085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
29	NC_008766	AGA	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582554
30	NC_008766	GC	3	6	1122	1127	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
31	NC_008766	CACG	2	8	1161	1168	25 %	0 %	25 %	50 %	121582554
32	NC_008766	CCGG	2	8	1191	1198	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
33	NC_008766	CGAC	2	8	1199	1206	25 %	0 %	25 %	50 %	121582554
34	NC_008766	ACT	2	6	1250	1255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582554
35	NC_008766	GAT	2	6	1380	1385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582554
36	NC_008766	CGA	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
37	NC_008766	CGC	2	6	1428	1433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
38	NC_008766	CGC	3	9	1488	1496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
39	NC_008766	CAG	3	9	1561	1569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
40	NC_008766	CAG	3	9	1579	1587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
41	NC_008766	GCCA	2	8	1615	1622	25 %	0 %	25 %	50 %	121582554
42	NC_008766	TGA	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582554
43	NC_008766	GCC	2	6	1699	1704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
44	NC_008766	CGCGG	2	10	1735	1744	0 %	0 %	60 %	40 %	121582554
45	NC_008766	GCA	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
46	NC_008766	CGG	3	9	1814	1822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
47	NC_008766	TGG	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582554
48	NC_008766	GCC	2	6	1954	1959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
49	NC_008766	ACG	2	6	2036	2041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
50	NC_008766	AGG	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582554
51	NC_008766	GGC	2	6	2193	2198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
52	NC_008766	CATCGC	2	12	2220	2231	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121582554
53	NC_008766	TCA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582554
54	NC_008766	CGACGG	2	12	2286	2297	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121582554
55	NC_008766	CGG	2	6	2384	2389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
56	NC_008766	GGC	2	6	2394	2399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
57	NC_008766	CGA	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
58	NC_008766	GCC	3	9	2416	2424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
59	NC_008766	GCA	2	6	2475	2480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
60	NC_008766	GCAA	2	8	2486	2493	50 %	0 %	25 %	25 %	121582554
61	NC_008766	CAG	2	6	2494	2499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
62	NC_008766	CAAGA	2	10	2677	2686	60 %	0 %	20 %	20 %	121582554
63	NC_008766	ATGA	2	8	2698	2705	50 %	25 %	25 %	0 %	121582554
64	NC_008766	CGG	2	6	2719	2724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
65	NC_008766	GTG	2	6	2734	2739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582554
66	NC_008766	CCTT	2	8	2747	2754	0 %	50 %	0 %	50 %	121582554
67	NC_008766	CGG	2	6	2810	2815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
68	NC_008766	CCG	3	9	2906	2914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
69	NC_008766	ACC	2	6	2936	2941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582554
70	NC_008766	CGA	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
71	NC_008766	CGC	2	6	3121	3126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
72	NC_008766	CGA	2	6	3141	3146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
73	NC_008766	GC	3	6	3169	3174	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
74	NC_008766	CCAG	2	8	3221	3228	25 %	0 %	25 %	50 %	121582554
75	NC_008766	AGC	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
76	NC_008766	TCA	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582554
77	NC_008766	AGC	2	6	3320	3325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
78	NC_008766	GC	3	6	3331	3336	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
79	NC_008766	CGG	2	6	3368	3373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
80	NC_008766	CGG	2	6	3419	3424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
81	NC_008766	CGG	2	6	3468	3473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
82	NC_008766	GCC	2	6	3481	3486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
83	NC_008766	AGG	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582554
84	NC_008766	CGC	2	6	3540	3545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
85	NC_008766	GCC	2	6	3550	3555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
86	NC_008766	CAG	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
87	NC_008766	GCA	2	6	3722	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
88	NC_008766	AAG	2	6	3790	3795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582554
89	NC_008766	GC	3	6	3797	3802	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
90	NC_008766	CGGC	2	8	3839	3846	0 %	0 %	50 %	50 %	121582554
91	NC_008766	ATC	2	6	3850	3855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582554
92	NC_008766	AAC	2	6	3856	3861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582554
93	NC_008766	GGC	2	6	3939	3944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
94	NC_008766	GCC	2	6	4010	4015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
95	NC_008766	AGC	2	6	4040	4045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
96	NC_008766	ACCG	2	8	4096	4103	25 %	0 %	25 %	50 %	121582554
97	NC_008766	AGG	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582554
98	NC_008766	AAG	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582554
99	NC_008766	GGC	2	6	4234	4239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
100	NC_008766	CGG	2	6	4292	4297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
101	NC_008766	CGA	3	9	4416	4424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
102	NC_008766	GGC	2	6	4495	4500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582554
103	NC_008766	AGC	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
104	NC_008766	GCC	2	6	4655	4660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
105	NC_008766	CAG	2	6	4666	4671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
106	NC_008766	AGC	2	6	4673	4678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
107	NC_008766	CAG	3	9	4702	4710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582554
108	NC_008766	CGC	2	6	4723	4728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582554
109	NC_008766	GCC	2	6	5072	5077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582555
110	NC_008766	AG	3	6	5091	5096	50 %	0 %	50 %	0 %	121582555
111	NC_008766	GCG	2	6	5120	5125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582555
112	NC_008766	GCG	2	6	5222	5227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582555
113	NC_008766	GTG	3	9	5324	5332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582555
114	NC_008766	GCC	2	6	5430	5435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582555
115	NC_008766	GAC	2	6	5437	5442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582555
116	NC_008766	CATCGC	2	12	5448	5459	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121582555
117	NC_008766	GCCGG	2	10	5485	5494	0 %	0 %	60 %	40 %	121582555
118	NC_008766	GCGCA	2	10	5548	5557	20 %	0 %	40 %	40 %	121582555
119	NC_008766	CCG	2	6	5583	5588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582555
120	NC_008766	CAG	3	9	5818	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582556
121	NC_008766	GCCC	2	8	5854	5861	0 %	0 %	25 %	75 %	121582556
122	NC_008766	TCA	2	6	5942	5947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582556
123	NC_008766	GTTC	2	8	5972	5979	0 %	50 %	25 %	25 %	121582556
124	NC_008766	GAC	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582556
125	NC_008766	GTC	2	6	6025	6030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582556
126	NC_008766	TGC	2	6	6237	6242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582557
127	NC_008766	GGC	2	6	6278	6283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582557
128	NC_008766	TCAA	2	8	6328	6335	50 %	25 %	0 %	25 %	121582557
129	NC_008766	CAATT	2	10	6358	6367	40 %	40 %	0 %	20 %	121582558
130	NC_008766	GCAGGG	2	12	6382	6393	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	121582558
131	NC_008766	TGGC	2	8	6416	6423	0 %	25 %	50 %	25 %	121582558
132	NC_008766	GCC	2	6	6530	6535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582558
133	NC_008766	CCG	2	6	6577	6582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582558
134	NC_008766	AGC	2	6	6599	6604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582558
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263	NC_008766	CGG	2	6	12557	12562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582568
264	NC_008766	CGTT	2	8	12587	12594	0 %	50 %	25 %	25 %	121582568
265	NC_008766	GCC	2	6	12640	12645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582568
266	NC_008766	GCT	2	6	12682	12687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582568
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268	NC_008766	CGGC	2	8	12818	12825	0 %	0 %	50 %	50 %	121582568
269	NC_008766	GCG	2	6	12861	12866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582568
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272	NC_008766	CGA	2	6	12991	12996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582568
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274	NC_008766	GC	3	6	13050	13055	0 %	0 %	50 %	50 %	121582568
275	NC_008766	GGCCG	2	10	13057	13066	0 %	0 %	60 %	40 %	121582568
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287	NC_008766	GGCCTT	2	12	13376	13387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582569
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386	NC_008766	GGC	2	6	16700	16705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582572
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389	NC_008766	CG	3	6	16774	16779	0 %	0 %	50 %	50 %	121582572
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